Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms