Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC39A12Q504Y0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms