Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
KRTAP20-1Q3LI63 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms