Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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RAB3GAP1Q15042 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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RAB3GAP1Q15042 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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RAB3GAP1Q15042 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3GAP1Q15042 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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