Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCLAFQ15004 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms