Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EXOSC2Q13868 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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