Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMB3Q13751 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LAMB3Q13751 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms