Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PWP1Q13610 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PWP1Q13610 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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