Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
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GRIN2AQ12879 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
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GRIN2AQ12879 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
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GRIN2AQ12879 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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GRIN2AQ12879 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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GRIN2AQ12879 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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GRIN2AQ12879 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
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GRIN2AQ12879 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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GRIN2AQ12879 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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GRIN2AQ12879 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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GRIN2AQ12879 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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GRIN2AQ12879 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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GRIN2AQ12879 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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