Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AP1B1Q10567 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP1B1Q10567 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms