Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CXCL9Q07325 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms