Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSPL2Q05D32 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms