Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms