Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF3P61204 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF3P61204 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF3P61204 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms