Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms