Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN8P56748 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms