Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms