Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms