Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPC1P35052 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms