Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPS1P31327 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPS1P31327 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPS1P31327 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPS1P31327 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPS1P31327 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPS1P31327 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPS1P31327 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPS1P31327 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPS1P31327 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPS1P31327 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPS1P31327 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPS1P31327 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPS1P31327 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPS1P31327 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPS1P31327 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPS1P31327 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CPS1P31327 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPS1P31327 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPS1P31327 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPS1P31327 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPS1P31327 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPS1P31327 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPS1P31327 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPS1P31327 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPS1P31327 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPS1P31327 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPS1P31327 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPS1P31327 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms