Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms