Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSFA2P28290 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms