Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IL3RAP26951 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
IL3RAP26951 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms