Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTAFRP25105 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms