Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRA1P14867 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms