Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFTRP13569 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFTRP13569 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFTRP13569 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFTRP13569 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFTRP13569 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFTRP13569 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFTRP13569 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFTRP13569 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CFTRP13569 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFTRP13569 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFTRP13569 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFTRP13569 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFTRP13569 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFTRP13569 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFTRP13569 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFTRP13569 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFTRP13569 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFTRP13569 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFTRP13569 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFTRP13569 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFTRP13569 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFTRP13569 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFTRP13569 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFTRP13569 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFTRP13569 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFTRP13569 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFTRP13569 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFTRP13569 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CFTRP13569 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFTRP13569 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFTRP13569 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFTRP13569 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFTRP13569 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFTRP13569 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFTRP13569 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFTRP13569 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFTRP13569 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFTRP13569 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFTRP13569 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFTRP13569 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFTRP13569 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFTRP13569 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFTRP13569 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CFTRP13569 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFTRP13569 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFTRP13569 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFTRP13569 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFTRP13569 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFTRP13569 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFTRP13569 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CFTRP13569 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFTRP13569 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFTRP13569 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFTRP13569 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFTRP13569 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFTRP13569 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFTRP13569 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFTRP13569 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFTRP13569 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFTRP13569 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFTRP13569 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFTRP13569 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFTRP13569 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFTRP13569 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFTRP13569 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFTRP13569 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms