Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD8P13378 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms