Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHGAP10645 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHGAP10645 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHGAP10645 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHGAP10645 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms