Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN9O95484 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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