Protein–RNA interactions for Protein: O75879

GATB, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATBO75879 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATBO75879 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATBO75879 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATBO75879 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATBO75879 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATBO75879 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATBO75879 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATBO75879 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATBO75879 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATBO75879 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATBO75879 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATBO75879 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATBO75879 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATBO75879 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATBO75879 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATBO75879 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATBO75879 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATBO75879 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATBO75879 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATBO75879 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATBO75879 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATBO75879 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATBO75879 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATBO75879 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATBO75879 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms