Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAF3IP2O43734 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2O43734 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms