Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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