Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBDO15205 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBDO15205 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBDO15205 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBDO15205 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBDO15205 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBDO15205 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms