Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F3O00716 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F3O00716 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms