Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN8O00124 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms