Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RGPD3A6NKT7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RGPD3A6NKT7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms