Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C5orf60A6NFR6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms