Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HMX2A2RU54 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMX2A2RU54 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms