Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHDC2Q9Y2U9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHDC2Q9Y2U9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms