Protein–RNA interactions for Protein: Q9R112

Sqor, Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqorQ9R112 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SqorQ9R112 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SqorQ9R112 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SqorQ9R112 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SqorQ9R112 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SqorQ9R112 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SqorQ9R112 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SqorQ9R112 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SqorQ9R112 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SqorQ9R112 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms