Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVP9

Ptk2b, Protein-tyrosine kinase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2bQ9QVP9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptk2bQ9QVP9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptk2bQ9QVP9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptk2bQ9QVP9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptk2bQ9QVP9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptk2bQ9QVP9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptk2bQ9QVP9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptk2bQ9QVP9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptk2bQ9QVP9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptk2bQ9QVP9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptk2bQ9QVP9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptk2bQ9QVP9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptk2bQ9QVP9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptk2bQ9QVP9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptk2bQ9QVP9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptk2bQ9QVP9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms