Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLK4Q9HAZ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK4Q9HAZ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK4Q9HAZ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK4Q9HAZ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK4Q9HAZ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK4Q9HAZ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLK4Q9HAZ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLK4Q9HAZ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLK4Q9HAZ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms