Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCM4

Dnal4, Dynein light chain 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal4Q9DCM4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnal4Q9DCM4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal4Q9DCM4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnal4Q9DCM4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnal4Q9DCM4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal4Q9DCM4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal4Q9DCM4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal4Q9DCM4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms