Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDEM3Q9BZQ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EDEM3Q9BZQ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDEM3Q9BZQ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDEM3Q9BZQ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms