Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PACSIN1Q9BY11 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PACSIN1Q9BY11 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms