Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LSM14BQ9BX40 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LSM14BQ9BX40 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LSM14BQ9BX40 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms