Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GBP6Q6ZN66 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBP6Q6ZN66 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GBP6Q6ZN66 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms