Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRPF38BQ5VTL8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF38BQ5VTL8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF38BQ5VTL8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms