Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRTP1Q5TC63 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRTP1Q5TC63 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms