Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q149G0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q149G0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q149G0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Q149G0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q149G0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q149G0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q149G0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q149G0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Q149G0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Q149G0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q149G0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q149G0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q149G0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q149G0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q149G0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q149G0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q149G0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q149G0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q149G0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q149G0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q149G0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q149G0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q149G0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q149G0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q149G0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q149G0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q149G0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q149G0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q149G0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q149G0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q149G0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q149G0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q149G0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q149G0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q149G0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q149G0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q149G0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q149G0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q149G0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q149G0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Q149G0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Q149G0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q149G0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q149G0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q149G0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q149G0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q149G0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q149G0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q149G0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q149G0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q149G0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q149G0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q149G0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q149G0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q149G0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q149G0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q149G0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q149G0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q149G0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q149G0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q149G0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q149G0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q149G0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q149G0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q149G0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q149G0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q149G0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q149G0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q149G0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Q149G0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q149G0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q149G0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Q149G0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q149G0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q149G0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q149G0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q149G0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Q149G0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q149G0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Q149G0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q149G0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q149G0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q149G0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q149G0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q149G0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q149G0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q149G0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q149G0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q149G0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q149G0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q149G0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q149G0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q149G0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q149G0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q149G0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q149G0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q149G0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q149G0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q149G0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms